python - HDF5 中的 XML 文件，h5py

Question

我正在使用 h5py 分组保存数据( float )。除了数据本身，我还需要在 hdf5 中包含一个附加文件(一个 .xml 文件，包含必要的信息)。我该怎么做呢？我的方法错了吗？

f = h5py.File('filename.h5')
f.create_dataset('/data/1',numpy_array_1)
f.create_dataset('/data/2',numpy_array_2)
.
.

我的 h5 树应该是这样的:

/ 
/data
/data/1 (numpy_array_1)
/data/2 (numpy_array_2)
.
.
/morphology.xml (?)

Answer 1

一种选择是将其添加为可变长度字符串数据集。

http://code.google.com/p/h5py/wiki/HowTo#Variable-length_strings

例如:

import h5py
xmldata = """<xml>
<something>
    <else>Text</else>
</something>
</xml>
"""

# Write the xml file...
f = h5py.File('test.hdf5', 'w')
str_type = h5py.new_vlen(str)
ds = f.create_dataset('something.xml', shape=(1,), dtype=str_type)
ds[:] = xmldata
f.close()

# Read the xml file back...
f = h5py.File('test.hdf5', 'r')
print f['something.xml'][0]