- c - 在位数组中找到第一个零
- linux - Unix 显示有关匹配两种模式之一的文件的信息
- 正则表达式替换多个文件
- linux - 隐藏来自 xtrace 的命令
首先,我可能应该说明我这样做的原因:我想尝试使用一些不同的微分方程求解器来比较我正在从事的项目的效率和内存使用情况。因此我想安装 Assimulo,因为它使用了一套求解器并且非常用户友好。
在安装它之前,我发现我需要安装“sundials”:
https://computation.llnl.gov/casc/sundials/download/download.html
因为我使用的是 64 位 ubuntu,所以我下载了它,解压缩并使用“-fPIC”标志安装它。安装“似乎”进行得很顺利,没有退出状态消息。
然后我使用这些说明安装了 assimulo:
http://www.jmodelica.org/assimulo_home/installation.html
我将“usr/local/lib”指定为安装日晷的路径,因为这是脚本运行时在终端中安装日晷的路径。
为了检查它是否正常工作,我下载并安装了 nose 来执行 nosetest,但是,它告诉我有问题。错误的一部分是:
======================================================================
ERROR: Failure: ImportError (No module named sundials)
----------------------------------------------------------------------
Traceback (most recent call last):
File "/usr/local/lib/python2.7/dist-packages/nose/loader.py", line 390, in loadTestsFromName
addr.filename, addr.module)
File "/usr/local/lib/python2.7/dist-packages/nose/importer.py", line 39, in importFromPath
return self.importFromDir(dir_path, fqname)
File "/usr/local/lib/python2.7/dist-packages/nose/importer.py", line 86, in importFromDir
mod = load_module(part_fqname, fh, filename, desc)
File "/usr/local/lib/python2.7/dist-packages/assimulo/tests/test_examples.py", line 21, in <module>
from assimulo.examples import *
File "/usr/local/lib/python2.7/dist-packages/assimulo/examples/cvode_gyro.py", line 22, in <module>
from assimulo.solvers import CVode
File "/usr/local/lib/python2.7/dist-packages/assimulo/solvers/__init__.py", line 23, in <module>
from sundials import IDA, CVode
ImportError: No module named sundials
nose 报告的其他五个错误非常相似。我理解它的意思,因为它似乎模块不在正确的位置,但我该如何修复它?
如果有人能帮助我,我将不胜感激。在过去的几天里,我对此做了一场绝对的噩梦。我是 Linux 的新手并且一直在尽我最大的努力,但我安装的所有东西似乎都无法正常工作。
操作系统:Ubuntu 12.10 64 位。 python 版本:2.7Numpy/Scipy 已安装。
编辑:这是我安装 assiumulo 的方式,如果有帮助,终端输出:
nathan@ubuntu:~/Documents/pythoncode/Assimulo-2.1.1$ sudo python setup.py install --sundials-home=/usr/local/lib
running install
running build
running config_cc
unifing config_cc, config, build_clib, build_ext, build commands --compiler options
running config_fc
unifing config_fc, config, build_clib, build_ext, build commands --fcompiler options
running build_src
build_src
building extension "assimulo.implicit_ode" sources
building extension "assimulo.ode" sources
building extension "assimulo.explicit_ode" sources
building extension "assimulo.problem" sources
building extension "assimulo.solvers.euler" sources
building extension "assimulo.lib.dopri5" sources
f2py options: []
adding 'build/src.linux-x86_64-2.7/fortranobject.c' to sources.
adding 'build/src.linux-x86_64-2.7' to include_dirs.
adding 'build/src.linux-x86_64-2.7/assimulo/thirdparty/hairer/dopri5-f2pywrappers.f' to sources.
building extension "assimulo.lib.rodas" sources
f2py options: []
adding 'build/src.linux-x86_64-2.7/fortranobject.c' to sources.
adding 'build/src.linux-x86_64-2.7' to include_dirs.
adding 'build/src.linux-x86_64-2.7/assimulo/thirdparty/hairer/rodas-f2pywrappers.f' to sources.
building extension "assimulo.lib.radau5" sources
f2py options: []
adding 'build/src.linux-x86_64-2.7/fortranobject.c' to sources.
adding 'build/src.linux-x86_64-2.7' to include_dirs.
adding 'build/src.linux-x86_64-2.7/assimulo/thirdparty/hairer/radau5-f2pywrappers.f' to sources.
build_src: building npy-pkg config files
running build_py
running build_ext
customize UnixCCompiler
customize UnixCCompiler using build_ext
customize GnuFCompiler
Could not locate executable g77
Could not locate executable f77
customize IntelFCompiler
Could not locate executable ifort
Could not locate executable ifc
customize LaheyFCompiler
Could not locate executable lf95
customize PGroupFCompiler
Could not locate executable pgfortran
customize AbsoftFCompiler
Could not locate executable f90
customize NAGFCompiler
Found executable /usr/bin/f95
customize VastFCompiler
customize CompaqFCompiler
Could not locate executable fort
customize IntelItaniumFCompiler
Could not locate executable efort
Could not locate executable efc
customize IntelEM64TFCompiler
customize Gnu95FCompiler
Found executable /usr/bin/gfortran
customize Gnu95FCompiler
customize Gnu95FCompiler using build_ext
running scons
running install_lib
running install_egg_info
Removing /usr/local/lib/python2.7/dist-packages/Assimulo-2.1.1.egg-info
Writing /usr/local/lib/python2.7/dist-packages/Assimulo-2.1.1.egg-info
running install_clib
customize UnixCCompiler
nathan@ubuntu:~/Documents/pythoncode/Assimulo-2.1.1$
最佳答案
安装 assimulo 时只尝试将 /usr
作为 sundials-home 目录。我在每个示例中搜索了日晷模块的文件 cvodes.h
,它位于 /usr/include/cvodes
。 sundials-home 目录使用的是 include 目录的父目录,所以 /usr
。
关于python - 安装 "Sundials"以使用 Assimulo,我们在Stack Overflow上找到一个类似的问题: https://stackoverflow.com/questions/14484877/
我正在处理一组标记为 160 个组的 173k 点。我想通过合并最接近的(到 9 或 10 个组)来减少组/集群的数量。我搜索过 sklearn 或类似的库,但没有成功。 我猜它只是通过 knn 聚类
我有一个扁平数字列表,这些数字逻辑上以 3 为一组,其中每个三元组是 (number, __ignored, flag[0 or 1]),例如: [7,56,1, 8,0,0, 2,0,0, 6,1,
我正在使用 pipenv 来管理我的包。我想编写一个 python 脚本来调用另一个使用不同虚拟环境(VE)的 python 脚本。 如何运行使用 VE1 的 python 脚本 1 并调用另一个 p
假设我有一个文件 script.py 位于 path = "foo/bar/script.py"。我正在寻找一种在 Python 中通过函数 execute_script() 从我的主要 Python
这听起来像是谜语或笑话,但实际上我还没有找到这个问题的答案。 问题到底是什么? 我想运行 2 个脚本。在第一个脚本中,我调用另一个脚本,但我希望它们继续并行,而不是在两个单独的线程中。主要是我不希望第
我有一个带有 python 2.5.5 的软件。我想发送一个命令,该命令将在 python 2.7.5 中启动一个脚本,然后继续执行该脚本。 我试过用 #!python2.7.5 和http://re
我在 python 命令行(使用 python 2.7)中,并尝试运行 Python 脚本。我的操作系统是 Windows 7。我已将我的目录设置为包含我所有脚本的文件夹,使用: os.chdir("
剧透:部分解决(见最后)。 以下是使用 Python 嵌入的代码示例: #include int main(int argc, char** argv) { Py_SetPythonHome
假设我有以下列表,对应于及时的股票价格: prices = [1, 3, 7, 10, 9, 8, 5, 3, 6, 8, 12, 9, 6, 10, 13, 8, 4, 11] 我想确定以下总体上最
所以我试图在选择某个单选按钮时更改此框架的背景。 我的框架位于一个类中,并且单选按钮的功能位于该类之外。 (这样我就可以在所有其他框架上调用它们。) 问题是每当我选择单选按钮时都会出现以下错误: co
我正在尝试将字符串与 python 中的正则表达式进行比较,如下所示, #!/usr/bin/env python3 import re str1 = "Expecting property name
考虑以下原型(prototype) Boost.Python 模块,该模块从单独的 C++ 头文件中引入类“D”。 /* file: a/b.cpp */ BOOST_PYTHON_MODULE(c)
如何编写一个程序来“识别函数调用的行号?” python 检查模块提供了定位行号的选项,但是, def di(): return inspect.currentframe().f_back.f_l
我已经使用 macports 安装了 Python 2.7,并且由于我的 $PATH 变量,这就是我输入 $ python 时得到的变量。然而,virtualenv 默认使用 Python 2.6,除
我只想问如何加快 python 上的 re.search 速度。 我有一个很长的字符串行,长度为 176861(即带有一些符号的字母数字字符),我使用此函数测试了该行以进行研究: def getExe
list1= [u'%app%%General%%Council%', u'%people%', u'%people%%Regional%%Council%%Mandate%', u'%ppp%%Ge
这个问题在这里已经有了答案: Is it Pythonic to use list comprehensions for just side effects? (7 个答案) 关闭 4 个月前。 告
我想用 Python 将两个列表组合成一个列表,方法如下: a = [1,1,1,2,2,2,3,3,3,3] b= ["Sun", "is", "bright", "June","and" ,"Ju
我正在运行带有最新 Boost 发行版 (1.55.0) 的 Mac OS X 10.8.4 (Darwin 12.4.0)。我正在按照说明 here构建包含在我的发行版中的教程 Boost-Pyth
学习 Python,我正在尝试制作一个没有任何第 3 方库的网络抓取工具,这样过程对我来说并没有简化,而且我知道我在做什么。我浏览了一些在线资源,但所有这些都让我对某些事情感到困惑。 html 看起来
我是一名优秀的程序员,十分优秀!