python - Jupyter 笔记本 rpy2 Rmagics : How to set the default plot size?

Question

我在 Jupyter 笔记本中使用 %%R 细胞魔法。我知道您可以为每个单元格设置绘图大小，例如:

%%R -w 800 -h 600

但我想为整个笔记本/R session 设置一个默认值。

我看过the documentation , 见过 this blog post on the R Jupyter Notebook Kernel ，并看过Plot Size - Using ggplot2 in IPython Notebook (via rmagic)关于按单元格设置绘图大小，但除非我错过了一些明显的东西，否则似乎没有办法为 R 魔法中的绘图设置默认绘图大小。

这可能吗？是否有隐藏设置，或者必须为每个单元格单独设置 -w 和 -h？

Answer 1

老问题，但我只是有同样的痒，找到了这个页面，然后设法抓到了它，所以希望这对某人有用。

解决方法是猴子修补 rpy2，它直接调用 R 的 png 方法，而无需设置默认参数。请注意，这种方法通常是一个坏主意，而且很脆弱，但无法避免。为 rpy2 提出一个包含默认参数机制的功能请求可能是值得的。

下面是猴子补丁:

# these are the defaults we want to set:
default_units = 'in' # inch, to make it more easily comparable to matpplotlib
default_res = 100 # dpi, same as default in matplotlib
default_width = 10
default_height = 9
# try monkey-patching a function in rpy2, so we effectively get these
# default settings for the width, height, and units arguments of the %R magic command
import rpy2
old_setup_graphics = rpy2.ipython.rmagic.RMagics.setup_graphics

def new_setup_graphics(self, args):
    if getattr(args, 'units') is not None:
        if args.units != default_units: # a different units argument was passed, do not apply defaults
            return old_setup_graphics(self, args)
    args.units = default_units
    if getattr(args, 'res') is None:
        args.res = default_res
    if getattr(args, 'width') is None:
        args.width = default_width
    if getattr(args, 'height') is None:
        args.height = default_height        
    return old_setup_graphics(self, args)

rpy2.ipython.rmagic.RMagics.setup_graphics = new_setup_graphics