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我正在尝试获取 scipy 稀疏矩阵的条件数。到目前为止,我设法做到这一点的方法是将矩阵转换为密集矩阵,然后获取它的特征值:
$ python
Python 3.5.2 (v3.5.2:4def2a2901a5, Jun 26 2016, 10:47:25)
[GCC 4.2.1 (Apple Inc. build 5666) (dot 3)] on darwin
Type "help", "copyright", "credits" or "license" for more information.
>>> from numpy import array
>>> import numpy as np
>>> import scipy.sparse as sparse
>>> I = array([0,3,1,0])
>>> J = array([0,3,1,2])
>>> V = array([4,5,7,9])
>>> A = sparse.coo_matrix((V,(I,J)),shape=(4,4))
>>> A = A.todense()
>>> eig = np.linalg.eig(A)
>>> eig = eig[0].real, np.array(eig[1].real)
>>> def split(array, cond):
... return (array[cond], array[~cond])
...
>>> eigv, zero = split(eig[0], eig[0]>1e-10)
>>> cond = max(eigv) / min(eigv)
>>> cond
1.75
如您所料,这对于大型矩阵来说是不可行的。我想知道这在 Python 中是如何正确完成的?
最佳答案
正如 Augusto Sisa 提到的,条件数定义为
条件(A):=||A|| ||A^{-1}||
但这很重要,即最大特征值的大小与最小(按大小)特征值的大小之比。因此,使用 scipy.sparse.linalg.eigs()
Scipy reference manual 获取这些值更有意义并找出你自己。
import scipy.sparse
import scipy.sparse.linalg
ew1, ev = lg.eigsh(A, which='LM')
ew2, ev = lg.eigsh(K, sigma=1e-8) #<--- takes a long time
ew1 = abs(ew1)
ew2 = abs(ew2)
condA = ew1.max()/ew2.min()
指定 sigma
选项是因为默认选项不能很好地找到最小的特征值。该选项以 shift-inverse 模式计算接近 sigma 的特征值。这一步需要很长时间。您可以通过将 k=
和 ncv=
选项指定为小于默认值的值来以牺牲准确性为代价来加快速度。例如 k=3
和 ncv=8
。但是你真的不知道你是否会得到这些特征值的良好近似值。您几乎总是会通过使用 k 参数计算更多特征值来提高准确性,但对于大多数用途而言,默认值应该足够准确。亲自测试以查看矩阵的差异。
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关于python - 稀疏矩阵的条件数,我们在Stack Overflow上找到一个类似的问题: https://stackoverflow.com/questions/43281468/
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