c++ - 将 numpy 指针 (dtype=np.bool) 传递给 C++

Question

我想在 C++ 中使用 bool 类型的 numpy 数组，方法是通过 Cython 传递它的指针。我已经知道如何使用其他数据类型，如 uint8。用 boolean 做同样的事情是行不通的。我可以编译，但运行时出现以下异常:

Traceback (most recent call last):
  File "test.py", line 15, in <module>
    c = r.count(b, 4)
  File "rect.pyx", line 41, in rect.PyRectangle.count (rect.cpp:1865)
    def count(self, np.ndarray[bool, ndim=1, mode="c"] array not None, int size):
ValueError: Does not understand character buffer dtype format string ('?')

这是我的 c++ 方法:

void Rectangle::count(bool * array, int size)
{
    for (int i = 0; i < size; i++){
        std::cout << array[i] << std::endl;
    }
}

Cython 文件:

# distutils: language = c++
# distutils: sources = Rectangle.cpp

import numpy as np
cimport numpy as np

from libcpp cimport bool

cdef extern from "Rectangle.h" namespace "shapes":
    cdef cppclass Rectangle:
        Rectangle(int, int, int, int) except +
        int x0, y0, x1, y1
        void count(bool*, int)

cdef class PyRectangle:
    cdef Rectangle *thisptr      # hold a C++ instance which we're wrapping
    def __cinit__(self, int x0, int y0, int x1, int y1):
        self.thisptr = new Rectangle(x0, y0, x1, y1)
    def __dealloc__(self):
        del self.thisptr

    def count(self, np.ndarray[bool, ndim=1, mode="c"] array not None, int size):
        self.thisptr.count(&array[0], size)

这里是调用该方法并产生错误的python脚本:

import numpy as np
import rect

b = np.array([True, False, False, True])
c = r.count(b, 4)

如果您需要更多信息，请告诉我。谢谢!

Answer 1

看起来问题出在数组类型声明上。根据 https://cython.readthedocs.org/en/latest/src/tutorial/numpy.html 上的文档尚不支持 boolean 数组，但您可以通过将它们转换为无符号八位整数数组来使用它们。这是一个简单的示例，它采用一维 boolean 值数组的总和(与 boolean NumPy 数组的 sum() 方法相同)

from numpy cimport ndarray as ar
cimport numpy as np
cimport cython

@cython.boundscheck(False)
@cython.wraparound(False)
def cysum(ar[np.uint8_t,cast=True] A):
    cdef int i, n=A.size, tot=0
    for i in xrange(n):
        tot += A[i]
    return tot

在您的 C++ 代码中，根据您正在执行的操作，您可能需要将指针转换回 boolean 值，我不确定。

编辑:这是一个如何在 Cython 中转换指针的示例，它应该可以满足您的需求。我仍然必须将数组键入为无符号 8 位整数，但我随后将指针转换回 boolean 值。

from numpy cimport ndarray as ar
cimport numpy as np
from libcpp cimport bool
cimport cython

def cysum(ar[np.uint8_t,cast=True] A):
    cdef int i, n=A.size, tot=0
    cdef bool *bptr
    bptr = <bool*> &A[0]
    for i in xrange(n):
        tot += bptr[i]
    return tot

如果您想将数组作为指针传入，您可以在 Cython 文件中使用以下函数:

cdef bool* arptr(np.uint8_t* uintptr):
    cdef bool *bptr
    bptr = <bool*> uintptr
    return bptr

可以称为

arptr(&A[0])