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python - 使用多处理时出现 PicklingError

转载 作者:IT老高 更新时间:2023-10-28 22:19:19 24 4
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在多处理模块中使用 Pool.map_async()(以及 Pool.map())时遇到问题。我已经实现了一个并行循环函数,只要 Pool.map_async 的函数输入是“常规”函数,它就可以正常工作。当功能是例如一个类的方法,然后我得到一个 PicklingError:

cPickle.PicklingError: Can't pickle <type 'function'>: attribute lookup __builtin__.function failed

我只使用 Python 进行科学计算,所以我对酸洗的概念不是很熟悉,今天刚刚了解了一点。我看过几个以前的答案,比如 Can't pickle <type 'instancemethod'> when using multiprocessing Pool.map() ,但我无法弄清楚如何使它工作,即使按照答案中提供的链接进行操作。

我的代码,其目标是使用多核模拟 Normal r.v 的向量。请注意,这只是一个示例,甚至可能无法在多核上运行。

import multiprocessing as mp
import scipy as sp
import scipy.stats as spstat

def parfor(func, args, static_arg = None, nWorkers = 8, chunksize = None):
"""
Purpose: Evaluate function using Multiple cores.

Input:
func - Function to evaluate in parallel
arg - Array of arguments to evaluate func(arg)
static_arg - The "static" argument (if any), i.e. the variables that are constant in the evaluation of func.
nWorkers - Number of Workers to process computations.
Output:
func(i, static_arg) for i in args.

"""
# Prepare arguments for func: Collect arguments with static argument (if any)
if static_arg != None:
arguments = [[arg] + static_arg for arg in list(args)]
else:
arguments = args

# Initialize workers
pool = mp.Pool(processes = nWorkers)

# Evaluate function
result = pool.map_async(func, arguments, chunksize = chunksize)
pool.close()
pool.join()

return sp.array(result.get()).flatten()

# First test-function. Freeze location and scale for the Normal random variates generator.
# This returns a function that is a method of the class Norm_gen. Methods cannot be pickled
# so this will give an error.
def genNorm(loc, scale):
def subfunc(a):
return spstat.norm.rvs(loc = loc, scale = scale, size = a)
return subfunc

# Second test-function. The same as above but does not return a method of a class. This is a "plain" function and can be
# pickled
def test(fargs):
x, a, b = fargs
return spstat.norm.rvs(size = x, loc = a, scale = b)

# Try it out.
N = 1000000

# Set arguments to function. args1 = [1, 1, 1,... ,1], the purpose is just to generate a random variable of size 1 for each
# element in the output vector.
args1 = sp.ones(N)
static_arg = [0, 1] # standarized normal.

# This gives the PicklingError
func = genNorm(*static_arg)
sim = parfor(func, args1, static_arg = None, nWorkers = 12, chunksize = None)

# This is OK:
func = test
sim = parfor(func, args1, static_arg = static_arg, nWorkers = 12, chunksize = None)

点击 Can't pickle <type 'instancemethod'> when using multiprocessing Pool.map() 中问题答案中提供的链接, Steven Bethard(几乎在最后)建议使用 copy_reg 模块。他的代码是:

def _pickle_method(method):
func_name = method.im_func.__name__
obj = method.im_self
cls = method.im_class
return _unpickle_method, (func_name, obj, cls)

def _unpickle_method(func_name, obj, cls):
for cls in cls.mro():
try:
func = cls.__dict__[func_name]
except KeyError:
pass
else:
break
return func.__get__(obj, cls)

import copy_reg
import types

copy_reg.pickle(types.MethodType, _pickle_method, _unpickle_method)

我真的不明白如何使用它。我唯一能想到的就是把它放在我的代码之前,但它没有帮助。一个简单的解决方案当然是只使用可行的解决方案,避免涉及 copy_reg。我更感兴趣的是让 copy_reg 正常工作以充分利用多处理,而不必每次都解决问题。

最佳答案

这里的问题不是“泡菜”错误消息而是概念性的:多进程确实在“ worker ”不同的进程中 fork 你的代码以执行它的魔力。

然后,它通过无缝序列化和反序列化数据(即使用 pickle 的部分)将数据发送到不同的进程或从不同的进程发送数据。

当来回传递的部分数据是一个函数时 - 它假设被调用进程中存在同名的函数,并且(我猜)将函数名作为字符串传递。由于函数是无状态的,被调用的工作进程只是用它收到的数据调用同一个函数。(Python函数不能通过pickle进行序列化,所以只在主进程和工作进程之间传递引用)

当你的函数是实例中的一个方法时——尽管当我们编写 python 代码时,它与函数很像,带有一个“自动”self 变量,但在下面就不一样了.因为实例(对象)是有状态的。这意味着工作进程没有对象的副本,该对象是您要在另一端调用的方法的所有者。

解决将方法作为函数传递给 map_async 调用的方法也不起作用 - 因为多进程只使用函数引用,而不是传递它时的实际函数。

因此,您应该 (1) 更改您的代码,以便将函数(而不是方法)传递给工作进程,将对象保持的任何状态转换为要调用的新参数。(2) 为 map_async 调用创建一个“目标”函数,该函数在工作进程端重建所需的对象,然后调用其中的函数。 Python 中最直接的类本身是可挑选的,因此您可以在 map_async 调用中传递作为函数所有者本身的对象 - “目标”函数将在工作端调用适当的方法本身。

(2) 可能听起来“困难”,但可能就是这样——除非你的对象的类不能被腌制:

import types

def target(object, *args, **kw):
method_name = args[0]
return getattr(object, method_name)(*args[1:])
(...)
#And add these 3 lines prior to your map_async call:


# Evaluate function
if isinstance (func, types.MethodType):
arguments.insert(0, func.__name__)
func = target
result = pool.map_async(func, arguments, chunksize = chunksize)

*免责声明:我没有测试过这个

关于python - 使用多处理时出现 PicklingError,我们在Stack Overflow上找到一个类似的问题: https://stackoverflow.com/questions/7016567/

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