Python将numpy数组插入sqlite3数据库

Question

我正在尝试在 sqlite3 数据库中存储大约 1000 个 float 的 numpy 数组，但我不断收到错误“InterfaceError:错误绑定(bind)参数 1 - 可能不受支持的类型”。

我的印象是 BLOB 数据类型可以是任何东西，但它绝对不适用于 numpy 数组。这是我尝试过的:

import sqlite3 as sql
import numpy as np
con = sql.connect('test.bd',isolation_level=None)
cur = con.cursor()
cur.execute("CREATE TABLE foobar (id INTEGER PRIMARY KEY, array BLOB)")
cur.execute("INSERT INTO foobar VALUES (?,?)", (None,np.arange(0,500,0.5)))
con.commit()

我可以使用另一个模块将 numpy 数组放入表中吗？或者我可以将numpy数组转换为sqlite可以接受的Python中的另一种形式(比如我可以拆分的列表或字符串)吗？性能不是优先事项。我只是想让它工作!

谢谢!

Answer 1

您可以使用 sqlite3 注册一个新的 array 数据类型:

import sqlite3
import numpy as np
import io

def adapt_array(arr):
    """
    http://stackoverflow.com/a/31312102/190597 (SoulNibbler)
    """
    out = io.BytesIO()
    np.save(out, arr)
    out.seek(0)
    return sqlite3.Binary(out.read())

def convert_array(text):
    out = io.BytesIO(text)
    out.seek(0)
    return np.load(out)


# Converts np.array to TEXT when inserting
sqlite3.register_adapter(np.ndarray, adapt_array)

# Converts TEXT to np.array when selecting
sqlite3.register_converter("array", convert_array)

x = np.arange(12).reshape(2,6)

con = sqlite3.connect(":memory:", detect_types=sqlite3.PARSE_DECLTYPES)
cur = con.cursor()
cur.execute("create table test (arr array)")

使用此设置，您可以简单地插入 NumPy 数组，而无需更改语法:

cur.execute("insert into test (arr) values (?)", (x, ))

并直接从 sqlite 中检索数组作为 NumPy 数组:

cur.execute("select arr from test")
data = cur.fetchone()[0]

print(data)
# [[ 0  1  2  3  4  5]
#  [ 6  7  8  9 10 11]]
print(type(data))
# <type 'numpy.ndarray'>